昭和２２年１２月、「食品衛生法」が制定されたことを契機に、官民協力して健康的な文化国家を目指すという目的で昭和２３年１１月に「社団法人日本食品衛生協会」が設立され、これに伴い各都道府県において食品衛生協会が設立されるなか、昭和３１年に青森県食品衛生協会を設立、昭和５５年に法人格が認可されました。
平成２５年４月、公益法人制度改革により一般社団法人に移行しました。